小樹，五歲，在雙親相繼過世後，跟著切羅基族的祖父母到山林裡一起生活。
在山林裡的日子，小樹見識到了大地之母所孕育的一切美好，並從爺爺身上學到了做人的態度與大自然的法則，從奶奶口中理解了學習的樂趣與心靈的重要性，更從他們身上學會了愛與包容；他也從許多有故事的人身上獲得了友情的滋潤，健康快樂地成長。
然而，某個秋天，大城市的人來了，強制把小樹送去孤兒院，認為「他在那裡才能夠得到應有的照顧」。習慣與自然為伍的小樹，到了孤兒院卻被認為「沒規矩」而多次受到處罰，他只能每天晚上對著天狼星表達自己有多想念祖父母和山上的家……
到底，小樹能不能再次回到山上與爺爺奶奶重逢呢？
生活在步調越來越快的當代社會，《少年小樹之歌》絕對會令你時而歡笑、時而熱淚盈眶，重新思考自己與大自然的關係、心靈健康的重要性，並再度找回人與人之間最真摯的感情。